Shadow Raids 將看到 Shadow Pokemon——Team Go Rocket 對普通 Pokemon 的險惡旋轉——在遊戲歷史上首次進入 Gym Raids。一星和三星 Shadow Raids 將於 5 月 22 日開始，特色神奇寶貝包括 Beldum、Poliwag、Machop 等，然後在 5 月 27 日 Shadow Mewtwo 將成為有史以來第一個五星 Shadow Raid。

Go Rocket 隊和 Shadow Mewtwo 佔領了時代廣場。

Shadow Raids 的功能與普通 raids 類似——多個玩家攻擊中心的單個 Pokemon——但有一個主要變化：當 raid Pokemon 的生命值達到一半時，三星和五星 Shadow Raid Pokemon 將進入一個新的 Enraged 狀態，遊戲將用新的動畫發出信號。憤怒的寶可夢提升了攻擊力和防禦力，這將使打敗它們比通常的突襲更加困難。

為了對抗這個增益，Niantic 還添加了暗影碎片，Go Rocket 成員在戰鬥後會掉落這些碎片。這些碎片可以製成純淨寶石，如果在暗影突襲中使用，會在短時間內帶走口袋妖怪的激怒狀態。玩家每次突襲可以使用不止一顆淨化寶石，如果同時使用多顆寶石，效果會疊加。

玩家需要在 Shadow Raid 體育館所在地才能參與，因為 Remote Raid Passes 不適用於這些類型的突襲。此外，與普通突襲不同，Premier Balls 不會在突襲完成後獲得團隊獎勵。

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